Vědecké působení
Výzkumný tým se zabývá využitím hmotnostní spektrometrie v lipidomické a metabolomické analýze, zejména ve spojení s ultravysokoúčinnou kapalinovou chromatografií nebo ultravysokoúčinnou superkritickou fluidní chromatografií. Hlavním cílem je vývoj nových analytických metod validovaných pro kvantitativní analýzu lipidů ve velkých sériích biologických vzorků. Klíčovou aplikací je analýza krve u pacientů s maligním nádorovým onemocněním za účelem nalezení dysregulovaných lipidů a jejich použití pro včasnou detekci rakoviny s pomocí vícerozměrné analýzy dat.
Mezinárodní spolupráce
Prof. Markus R. Wenk, National University of Singapore, Singapore
Dr. Gerhard Liebisch, Institute of Clinical Chemistry and Laboratory Medicine, University Hospital Regensburg, Germany
Dr. Kim Ekroos, Lipidomics Consulting, Finland
Dr. Harald C. Köfeler, Medical University in Graz, Austria
Pět nejvýznamnějších řešených projektů
Program: ERC Advanced, Název projektu: Oncolipidomics: Why is lipidomic dysregulation pattern in blood similar for various cancers?, Poskytovatel: ERC, Hlavní příjemce: Univerzita Pardubice / Fakulta chemicko-technologická, Řešitel: Prof. Ing. Michal Holčapek, Ph.D., Období řešení projektu: 2023 – 2028.
Program: ERC CZ, Název projektu: Hmotnostní spektrometrie při hledání lipidových biomarkerů pro včasnou diagnostiku rakoviny, Poskytovatel: MŠMT, Hlavní příjemce: Univerzita Pardubice / Fakulta chemicko-technologická, Řešitel: Prof. Ing. Michal Holčapek, Ph.D., Období řešení projektu: 2013 – 2018.
Program: OP JAK, Název projektu: Záchrana životů prostřednictvím výzkumu v oblasti včasné detekce a prevence rakoviny: Molekulární, genomické a sociální faktory, Poskytovatel: MŠMT, Spolupříjemce: Univerzita Pardubice / Fakulta chemicko-technologická, Řešitel: Prof. Ing. Michal Holčapek, Ph.D., Období řešení projektu: 2024 – 2028.
Program: GAČR Standardní projekty, Název projektu: Spojení vícerozměrné chromatografie a hmotnostní spektrometrie v kvantitativních přístupech pro detailní charakterizaci lipidomu lidské plazmy, Poskytovatel: GAČR, Hlavní příjemce: Univerzita Pardubice / Fakulta chemicko-technologická, Řešitel: Prof. Ing. Michal Holčapek, Ph.D., Období řešení projektu: 2021 – 2023.
Program: GAČR Standardní projekty, Název projektu: Charakterizace lidského lipidomu a metabolomu pro personalizovanou zdravotní péči a hledání biomarkerů: studie rakoviny ledvin, Poskytovatel: GAČR, Hlavní příjemce: Univerzita Pardubice / Fakulta chemicko-technologická, Řešitel: Prof. Ing. Michal Holčapek, Ph.D., Období řešení projektu: 2018 – 2020.
Pět nejvýznamnějších vědeckých publikací, případně patentů týmu za posledních 5 let
D. Wolrab, R. Jirásko, E. Cífková, M. Höring, D. Mei, M. Chocholoušková, O. Peterka, J. Idkowiak, T. Hrnčiarová, L. Kuchař, R. Ahrends, R. Brumarová, D. Friedecký, G. Vivo-Truyols, P. Škrha, J. Škrha, R. Kučera, B. Melichar, G. Liebisch, R. Burkhardt, M.R. Wenk, A. Cazenave-Gassiot, P. Karásek, I. Novotný, K. Greplová, R. Hrstka, M. Holčapek. Lipidomic profiling of human serum enables detection of pancreatic cancer. Nat. Commun. 2022, 13, 124. Dostupné z: DOI: 10.1038/s41467-021-27765-9
J.G. McDonald, C.S. Ejsing, D. Kopczynski, M. Holčapek, J. Aoki, M. Arita, M. Arita, E.S. Baker, J. Bertrand-Michel, J.A. Bowden, B. Brügger, S.R. Ellis, M. Fedorova, W.J. Griffiths, X. Han, J. Hartler, N. Hoffmann, J.P. Koelmel, H.C. Köfeler, T.W. Mitchell, V.B. O’Donnell, D. Saigusa, D. Schwudke, A. Shevchenko, C.Z. Ulmer, M.R. Wenk, M. Witting, D. Wolrab, Y. Xia, R. Ahrends, G. Liebisch, K. Ekroos, Nat. Met. 2022, 4, 1086–1088. Dostupné z: https://doi.org/10.1038/s42255-022-00628-3
Z. Vaňková, O. Peterka, M. Chocholoušková, D. Wolrab, R. Jirásko, M. Holčapek. Retention dependences in reversed-phase UHPLC/MS enable highly confident identification of lipid species in human plasma. Anal. Bioanal. Chem. 2022, 414, 319. Dostupné z: DOI: 10.1007/s00216-021-03492-4
M. Holčapek, E. Cífková, M. Lísa, R. Jirásko, D. Wolrab, T. Hrnčiarová, A method of diagnosing pancreatic cancer based on lipidomic analysis of a body fluid, European patent EP 3514545, datum žádosti 22. 1. 2018, uděleno 7. 10. 2020. Dostupné z: https://patents.google.com/patent/EP3514545B1/
M. Holčapek, D. Wolrab, R. Jirásko, E. Cífková, A method of diagnosing cancer based on lipidomic analysis of a body fluid, EP3575793, datum žádosti 29. 5. 2018, uděleno 19. 7. 2023. Dostupné z: https://patents.google.com/patent/EP3575793A1/
Nejvýznamnější získaná ocenění
Cena Neuron 2023 za propojení vědy a byznysu
Cena Rudolfa Lukeše za rok 2023, nadace Experientia
Dutton Award – cena American Oil Chemists’ Society za významný přínos k analýze olejů a tuků (2022)
Cena ministra školství, mládeže a tělovýchovy za mimořádné výsledky výzkumu, experimentálního vývoje a inovací v oblasti přírodních věd (2021)
Plaketa rektora Univerzity Pardubice za špičkový vědecký výkon a mimořádný přínos (2020)
Cena Vladimíra Hanuše za nejlepší práci v oboru hmotnostní spektrometrie za roky 2022, 2019 a 2016 (Spektroskopická společnost J.M.M.)
Ocenění Power List 2020, 2015 a 2013 pro 100 nejvlivnějších vědců na světě v oboru analytické chemie (časopis The Analytical Scientist)
